MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 plasmid pDRPIS7493

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015876	CTT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164904
2	NC_015876	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164904
3	NC_015876	AGT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164904
4	NC_015876	T	9	9	1894	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	342164905
5	NC_015876	A	9	9	1911	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	342164905
6	NC_015876	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	342164905
7	NC_015876	TACT	2	8	1951	1958	25 %	50 %	0 %	25 %	342164905
8	NC_015876	ACTT	2	8	1964	1971	25 %	50 %	0 %	25 %	342164905
9	NC_015876	TA	4	8	1972	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	342164905
10	NC_015876	TAT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164905
11	NC_015876	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342164905
12	NC_015876	A	6	6	2035	2040	100 %	0 %	0 %	0 %	342164905
13	NC_015876	A	6	6	2206	2211	100 %	0 %	0 %	0 %	342164906
14	NC_015876	TAG	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
15	NC_015876	AAAG	2	8	2353	2360	75 %	0 %	25 %	0 %	342164906
16	NC_015876	TGA	2	6	2525	2530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
17	NC_015876	AAATT	2	10	2546	2555	60 %	40 %	0 %	0 %	342164906
18	NC_015876	AGA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
19	NC_015876	TGC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342164906
20	NC_015876	TTC	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342164906
21	NC_015876	TCAAA	3	15	2658	2672	60 %	20 %	0 %	20 %	342164906
22	NC_015876	ATT	2	6	2680	2685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164906
23	NC_015876	TGA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164906
24	NC_015876	AG	3	6	2781	2786	50 %	0 %	50 %	0 %	342164906
25	NC_015876	AGA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
26	NC_015876	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	342164906
27	NC_015876	CAAG	2	8	2958	2965	50 %	0 %	25 %	25 %	342164906
28	NC_015876	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164906
29	NC_015876	GACA	2	8	2981	2988	50 %	0 %	25 %	25 %	342164906
30	NC_015876	T	6	6	3000	3005	0 %	100 %	0 %	0 %	342164906
31	NC_015876	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
32	NC_015876	ACC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
33	NC_015876	ACT	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342164907
34	NC_015876	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164907
35	NC_015876	CCA	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
36	NC_015876	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	342164907
37	NC_015876	CTC	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342164907
38	NC_015876	ACC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
39	NC_015876	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342164907
40	NC_015876	TGT	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164907
41	NC_015876	AGA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342164907
42	NC_015876	TAAA	2	8	3623	3630	75 %	25 %	0 %	0 %	342164907
43	NC_015876	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	342164907
44	NC_015876	T	6	6	3660	3665	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
45	NC_015876	T	8	8	3722	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
46	NC_015876	ATT	2	6	3731	3736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
47	NC_015876	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	342164908
48	NC_015876	ATA	2	6	3812	3817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908
49	NC_015876	TAT	3	9	3822	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342164908
50	NC_015876	TAG	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342164908
51	NC_015876	TGT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342164908
52	NC_015876	G	6	6	3921	3926	0 %	0 %	100 %	0 %	342164908
53	NC_015876	GTAT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	25 %	0 %	342164908
54	NC_015876	AAT	2	6	3976	3981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342164908

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.